1 福建农林大学, 农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室, 福州, 350002; 2 福建农林大学生命科学学院, 福州, 350002; 3 福建师范大学福清分校海洋与生化工程学院, 福清, 350300
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 13 篇
收稿日期: 2019年10月12日 接受日期: 2019年10月15日 发表日期: 2020年12月10日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 13 篇
收稿日期: 2019年10月12日 接受日期: 2019年10月15日 发表日期: 2020年12月10日
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摘 要
查尔酮合成酶(chalcone synthase CHS)是植物类黄酮生物合成途径的第一个关键酶,在植物的次生代谢途径中发挥重要作用。本研究基于课题组构建的甘蔗转录组数据库,挖掘获得7个具有完整编码区的甘蔗ScCHS基因(ScCHS1~ScCHS7)。序列分析结果显示,ScCHS1~ScCHS7基因大约编码400个氨基酸,7者之间的氨基酸序列相似性介于12.47%~87.22%,且其编码蛋白均含有c (Cys)、f (Phe)、h (His)和n (Asn)这4个构成CHS蛋白催化中心的保守残基。系统进化树分析表明,ScCHS1、ScCHS2和ScCHS6聚类在CHS家族的第Ⅵ亚类,ScCHS3和ScCHS4聚在第Ⅲ亚类,ScCHS5聚在第Ⅴ亚类,ScCHS7聚在第Ⅷ亚类。实时荧光定量PCR (quantitative real-time PCR, qRT-PCR)结果显示,接种甘蔗黑穗病菌(Sporisorium scitamineum)后,ScCHS1基因的表达水平在感黑穗病品种ROC22中没有显著变化,但在抗黑穗病品种NCo376中被诱导上调,此外,在低氮胁迫下,ScCHS1基因转录本在ROC22叶片和根部组织中均被诱导上调,表明ScCHS1基因积极响应甘蔗黑穗病菌和低氮胁迫处理。以上结果为深入研究甘蔗ScCHS家族基因的结构和功能提供了参考资料。
关键词
甘蔗;查尔酮合成酶基因;生物信息学分析;表达模式分析