苏艳丽 , 毛娟 , 马宗桓 , 何红红 , 卢世雄 , 王萍萍 , 陈佰鸿^*

甘肃农业大学园艺学院, 兰州, 730070
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 23 篇   
收稿日期: 2019年09月26日    接受日期: 2019年09月27日

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本试验从苹果(Malus pumila Mill)转录组数据库中挖掘 SSR 标记，发现其 SSR 标记类型共有六种，分别为：单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸，其中频率较高的重复类型为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸。从 41 890 条苹果无冗余转录组序列中共搜索到了 1 803 条至少含有 1 个 SSR 的序列，占转录组的 4.30%。高频重复类型为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸，其中数量最多的是 A/T，其次是AG/CT 和 GAG/CTC，共占 SSRs 的 98.23%。该试验共设计了 20 对引物，分别对 20 份苹果材料进行 PCR 扩增。结果显示：20 对引物均能扩增出条带，平均扩增条数为 2.7。并对供试的 20 份苹果品种进行了聚类分析，结果与形态学及生物学分类基本一致，证明品种间亲缘关系的远近具有一定的规律，栽培品种与砧木品种的种间亲缘关系较远，而栽培种和砧木品种的种内亲缘关系较近。另外，本研究为杂交育种挑选合适的亲本，杂交育种以及培育作物新品种提供了一定的理论基础。
 

苹果(Malus pumila Mill)；转录组 -SSR；分子标记；PCR 扩增；遗传多样性