郁晓敏¹ , 金杭霞¹ , 杨清华¹ , 傅旭军¹ , 郭丹丹¹ , 吕晓男² , 袁凤杰^1*

1 浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所, 杭州, 310021; 2 浙江省农业科学院, 农业农村部农产品信息溯源重点实验室, 杭州, 310021
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2019年09月23日    接受日期: 2019年09月27日    发表日期: 2021年03月14日

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种皮色不仅是一个形态标记，还是一种重要的进化性状，与大豆商品性、营养价值以及抗性关系密切。本研究以黄色种皮大豆品系 BMY 及其褐色种皮衍生品系 BMZ 为亲本，从 F2 群体中分别挑选出黄色种皮和褐色种皮的植株各 9 株，构建了两个极端性状混合池 DNA 文库，借助 SLAF-seq 和 BSA 技术，挖掘大豆种皮色性状相关候选基因。对于 26 121 个高质量 SNP 位点，利用 SNP-index 方法和 ED 方法进行综合分析，获得 8 个与目标性状紧密关联的候选区域，分别位于第 5、11、12、19 和 20 染色体，包含 620 个编码基因。对这 620 个基因进行进一步的功能注释，NR、Swiss-Prot、GO、KEGG 和 COG 数据库分别注释到 600、518、533、133 和 256 个基因，其中存在非同义突变基因 4 个，分别为 Glyma05g005600、Glyma05g009700、Glyma12g006100 和 Glyma12g047300。候选区域内编码基因的深度注释有助于功能基因的进一步分离，为大豆种皮色性状相关基因的精细定位及克隆提供理论依据。
 

大豆；种皮色；重测序； 关联分析