研究报告

海南油茶 SRAP-PCR 体系优化及有效引物筛选  

戚华沙1,2 , 陈加利2 , 杨立荣2 , 孙秀秀2 , 郑道君2 , 于靖1,2*
1 海南大学园艺学院, 海口, 570228; 2 海南省农业科学院热带园艺研究所, 海南省热带特种经济植物种质资源创新利用重点实验室, 海口,571100
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 21 篇   
收稿日期: 2019年09月20日    接受日期: 2019年09月27日    发表日期: 2020年06月01日
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摘 要

海南岛为中国油茶资源分布的最南缘,海南油茶资源丰富,特色显著。本研究以海南油茶基因组 DNA 为模板,采用单因素试验和正交试验相结合的方法,分析 DNA 浓度、dNTPs 浓度、Taq DNA 聚合酶用量和引物浓度对海南油茶 SRAP-PCR 扩增结果的影响,构建海南油茶 SRAP-PCR 体系,对多态性引物组合进行筛选,为 SRAP 分子标记在海南油茶资源遗传多样性评价和鉴定提供条件。单因素试验结果表明:在本试验中,海南油茶基因组 DNA 浓度高低对扩增效率影响不大,低浓度 dNTPs 有利于获得较好的扩增产物,而中高浓度的 Taq 酶和引物可提高扩增效果。正交试验结果表明:在适宜浓度范围内,各因素对海南油茶 SRAP-PCR 扩增影响大小依次为:引物>dNTPs>Taq DNA 聚合酶>模板 DNA;总体系为 20 μL 时,最佳反应体系中模板 DNA 用量为 5 ngdNTPs 浓度为 0.20 mmol/L,引物浓度为 0.60 μmol/L 以及 Taq DNA 聚合酶用量为 4.00 U。采用稳定 SRAP-PCR 体系,对 400 SRAP 引物进行筛选,获得 32 对多态性好、条带清晰的有效引物,可用于海南油茶遗传多样性分析和种质资源鉴定等研究。
 

关键词
海南油茶;SRAP-PCR;体系优化;引物筛选
《分子植物育种》印刷版
• 第 18 卷
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