郭李智¹ , 宗渊² , 席杏媛 ² , 李建民 ^1* , 刘宝龙^2*

1 青海师范大学生命科学学院, 西宁, 810008; 2 中国科学院西北高原生物研究所, 青海省作物分子育种重点实验室, 西宁, 810001
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《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2019年09月16日    接受日期: 2019年09月20日    发表日期: 2021年03月14日

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当归提前抽薹严重影响产量，而当归抽薹分子遗传机理尚不清楚。本研究利用 RNA-seq 技术对连续五代抽薹当归的叶片、茎段、种子、根进行测序，对所有组装后的 Unigenes 进行功能注释，寻找调控当归抽薹主要候选基因。结果表明：在当归的叶片、根、种子、茎段转录本中分别得到 7.1、7.63、7.23、6.59 Gb 数据，通过 Nr、Nt、Swissprot、KEGG、KOG、Interpro、GO、Intersection、Overall 等蛋白数据库进行蛋白质预测，分别预测了 71 024、59 931、49 694、51 832、55 320、46 908、35 598、17 133、79 161 个蛋白。所有转录本中 80.13%预测蛋白与胡萝卜同源。在 KEGG 通路中共有 2 666 个差异表达的基因参与植物信号传导；与拟南芥、胡萝卜、芥菜中参与调控开花相关基因比对，共筛选出 56 条候选基因，将 56 条候选基因在 NCBI 中进行核酸比对，得到与直接控制抽薹 AP1 转录因子同源的 Unigene45683_All、激活 AP1 转录因子的整合子 FT 和 FD 同源的 Unigene11264_All、参与拟南芥光周期调控基因 CO (CONSTANS)的同源基因Unigene4344_All、在芥菜中促 进 抽 薹 整 合 因 子 SOC1 的 表 达 的 AGL24 或 直 接 作 用 于 抽 薹 决 定 基 因 LFY 的 同 源 基 因 Unigene46836_All、Unigene7820_All、CL10006.Contig2_All。因此，上述候选基因很有可能参与调控当归抽薹相关分子机制。本研究筛选到与当归抽薹相关的候选基因，有助于了解当归抽薹相关分子机制，为挖掘控制当归抽薹相关基因提供理论依据
 

当归(Angelica sinensis)；抽薹； RNA-seq；同源基因