尚鸿运 , 高志勇^*

武汉大学生命科学学院, 杂交水稻国家重点实验室, 武汉, 430072
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 20 篇   
收稿日期: 2019年09月11日    接受日期: 2019年09月16日    发表日期: 2020年11月04日

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加权基因共表达网络分析(WGCNA)是一种用于鉴定协同表达的基因模块的方法。为探究拟南芥天然抗病基因，本研究利用 WGCNA 分析拟南芥受白粉菌 UCSC1 (Erysiphe cichoracearum)侵染后的表达情况，挖掘其转录组的差异表达基因，构建基因共表达网络并识别协同表达的基因模块。筛选出与白粉菌侵染最相关的基因模块，并进行验证分析以确认鉴定的基因。功能富集分析结果表明：模块基因富集于机体获得性免疫，水杨酸生物合成等多个抗病相关通路，值得继续挖掘与拟南芥抗病过程的更多功能性关联。其他基因功能仍需鉴定，本研究为拟南芥抗病及植物育种研究提供了新思路。 
 

加权基因共表达网络；拟南芥； 白粉菌；转录组