华北理工大学生命科学学院, 唐山, 063210
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 15 篇
收稿日期: 2019年09月10日 接受日期: 2019年09月13日 发表日期: 2020年11月04日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 15 篇
收稿日期: 2019年09月10日 接受日期: 2019年09月13日 发表日期: 2020年11月04日
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摘 要
为了探索哈茨木霉厚垣孢子形成机制,分别在产厚垣孢子与不产厚垣孢子两种不同的培养条件下培养哈茨木霉 Tr-9 菌株,利用转录组测序寻找可能与厚垣孢子形成有关的差异表达基因。结果共得到 15 956 个 Unigenes,其中 11 015 个 Unigene 能注释到 Unigenes 蛋白数据库中。通过比较两个样本,得到 1 639 个差异表达基因,其中 826 个基因表达上调,813 个基因表达下调。共有 845 个差异基因被注释到 GO (Gene ontology)数据库中,富集最为显著前三个 GO 条目分别为 DNA 结合、RNA 聚合酶Ⅱ启动子的转录及转录调控,和细胞核。KEGG (Kyoto encyclopedia of genes and genomes)富集分析发现,丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢途径与缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解代谢途径为具有显著性富集的两条代谢途径。本研究为哈茨木霉厚垣孢子的研究开发提供一定的基础理论参考。
关键词
哈茨木霉(Trichoderma harzianum);厚垣孢子;转录组测序; 差异表达基因