大理大学基础医学院, 生物化学与分子生物学实验室, 大理, 671000
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《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 9 篇
收稿日期: 2019年08月31日 接受日期: 2019年09月04日 发表日期: 2020年11月04日
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《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 9 篇
收稿日期: 2019年08月31日 接受日期: 2019年09月04日 发表日期: 2020年11月04日
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摘 要
为了更好地了解烟草叶绿体基因组中 RNA 编辑位点的数量及它们发挥的功能,本研究借助烟草3 种器官(叶, 花, 根)的基因组测序数据及 RNA 测序数据,对烟草叶绿体基因组里胞嘧啶(C)转换为尿嘧啶(U)的 RNA 编辑位点进行了鉴定。在烟草叶绿体基因组中,发现了 1 002 个 RNA 编辑位点。609 个编辑位点位于 63 个蛋白编码基因,占所有编辑位点的 60.8%,其中无义突变的编辑位点 46 个。蛋白编码基因中,rpoC2、ycf1 和 ndhD 发生的编辑位点最多,RNA 基因中 trnG、trnfM 和 trnD 有最多的编辑位点。对叶、花和根中的编辑位点进行比较,根的 RNA 编辑位点最多,为 652 个。这些无义突变的 RNA 编辑位点,在花、根中主要是影响参与光合作用的基因,而在叶中这些基因未受影响。表明 RNA 编辑作为转录后调控的一种方式,对于维持不同器官的功能是非常重要的。本研究为进一步研究烟草 RNA 编辑的生物学功能提供帮助。
关键词
烟草(Nicotiana tabacum);叶绿体;RNA 编辑;二代测序