连卜颍^1,2 , 王喆^1,2 , 韩尚玲^1,2 , 侯思宇^1,2,3 , 韩渊怀^1,2,3* , 李红英^1,2,3

1 山西农业大学农学院, 太谷, 030801; 2 山西农业大学, 农业生物工程研究所, 太谷, 030801; 3 山西农业大学, 杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室, 太谷, 030801
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2019年08月22日    接受日期: 2019年09月27日    发表日期: 2020年04月29日

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为深入解析谷子 TCP 基因家族的功能，通过生物信息学方法对谷子 TCP 转录因子家族基因成员序列特征、基因结构、染色体定位、系统进化关系及表达模式进行分析。结果表明：除第 8 染色体之外，从谷子基因组上其余 8 条染色体中共鉴定出 26 个 TCP 家族成员，并根据其在染色体的顺序和位置先后进行命名，其中分布在第 3 和第 5 染色体上的 TCP 家族成员数量最多，高达 5 个。不同家族成员其编码的氨基酸残基数目具有明显差异，范围为 95 aa~451 aa。其中 SiTCP21 基因编码氨基酸残基数目最少为 95 个氨基酸；而SiTCP15 最多为 451 个氨基酸残基。26 个 TCP 家族成员的蛋白结构中均含有 bHLH 保守结构域。基因表达分析结果表明，31%的成员在穗中的表达量明显高于其他组织，因此推测该基因家族可能对谷子穗部生长发育的调控起关键作用。本研究对深入研究 SiTCPs 家族基因的功能奠定了基础，也为谷子生长发育的调控机制提供了新的思路。

谷子(Setaria italica)；TCP；转录因子；生物信息学分析；基因表达分析