研究报告

木薯MeAKT1基因的克隆及生物信息学分析  

陈秀珍1 , 白雪杨1 , 朱云峰1 , 刘银弟1 , 江行玉1 , 周扬2*
1 海南大学热带作物学院, 海南省耐盐作物生物技术重点实验室, 海口, 570228; 2 海南大学园艺学院, 海口, 570228
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 7 篇   
收稿日期: 2019年08月12日    接受日期: 2019年08月20日    发表日期: 2020年02月17日
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摘 要

植物细胞中的 K+通道蛋白 AKT1 (Arabidopsis K+ transpoter 1)主要负责吸收 K+。本研究基于木薯基因组数据库信息,利用 PCR 技术从木薯中克隆一个 MeAKT1 基因,该基因全长 2 634 bp,编码 877 个氨基酸,生物信息学分析表明 MeAKT1 含有 10 个外显子和 9 个内含子,编码的氨基酸分子量为 99.02 kD,等电点为 8.43,属于稳定蛋白。MeAKT1 包含有 5 个跨膜区域,N 端含有 1 Ion_trans 结构域,C 端有 1 KHA结构域,其二级结构以 - 螺旋和无规则卷曲为主,进化树分析发现 MeAKT1与蓖麻 RcAKT1 的亲缘关系最近。通过对 MeAKT1 蛋白的生物信息学分析有助于下一步深入研究 MeAKT1在木薯耐贫瘠过程中的功能。

关键词
木薯(Manihot esculenta Crantz); K+通道蛋白; AKT1;生物信息学分析
《分子植物育种》印刷版
• 第 18 卷
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