延边大学农学院, 延吉, 133002
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 15 篇
收稿日期: 2019年08月11日 接受日期: 2019年08月16日 发表日期: 2020年09月11日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 15 篇
收稿日期: 2019年08月11日 接受日期: 2019年08月16日 发表日期: 2020年09月11日
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摘 要
为探究山葡萄在转色不同时期的相关差异表达基因,本研究以不同转色时期的果皮为试验材料,用 Illumina HiSeq 平台进行测序,共获得 39.83 Gb Clean Data。根据基因在不同样品中的表达量识别差异表达基因,并对其进行功能注释和富集分析,在获得的 29 315 个 Unigenes 中,通过与 Nr、GO、COG、SwissProt和 KEGG 数据库进行比对分析发现,山葡萄 Unigenes 与葡萄亲缘性最高,差异基因数量在 COG 数据库中随着转色程度的加深而呈上升趋势,其不同时期行使生物学过程中的细胞杀伤和分子功能中的营养贮存活性也呈增加趋势。本研究结果为进一步探究山葡萄不同时期的差异表达基因及分子机制提供了可参考数据。
关键词
山葡萄(Vitis amurensis R.);转录组; 差异表达基因; 功能注释