1河北北方学院农林科技学院,张家口, 075131; 2河北北方学院动物科技学院,张家口, 075131; 3河北北方学院理学院,张家口, 075000
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 6 篇
收稿日期: 2019年08月08日 接受日期: 2019年08月15日 发表日期: 2020年10月29日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 6 篇
收稿日期: 2019年08月08日 接受日期: 2019年08月15日 发表日期: 2020年10月29日
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摘 要
为了研究仁用杏花的转录组信息以及寻找室温(CK)和低温处理的仁用杏花的差异表达基因,本试验以抗寒性强的仁用杏品种‘围选 1号’的花为试验材料,采用高通量转录组测序技术对室温(CK)和低温处理的‘围选 1号’的花进行转录组测序。测序结果显示,共获得 Transcript和 Unigene分别为 116 957条和31 360条,其中 N50分别为 2 311 nt和 2 262 nt。使用 BLAST软件将 Transcript序列与 NR、GO、Swiss-Prot、KOG和 KEGG数据库比对,注释到各数据库的序列分别为 84 231条、12 955条、60 914条、50 978条和7 185条。并对 CK和低温处理的样品之间表达量方差最大的前 50个基因做聚类分析,结果分为两大类,第一类有 12个基因,在 CK中表达量较高,在低温处理中表达量较低;第二类有 38个基因,在低温处理中表达量较高,在 CK中表达量较低。此研究结果获得了仁用杏花的转录信息,并寻找到了室温(CK)和低温处理的仁用杏花的差异表达基因,为今后采取基因工程手段培育抗寒的仁用杏新品种提供了基因资源。
关键词
仁用杏花;转录组测序;低温胁迫