庞强强 , 蔡兴来 , 孙晓东 , 张文 , 周曼

海南省农业科学院蔬菜研究所, 海南省蔬菜生物学重点实验室, 海南省瓜菜育种工程技术研究中心, 海口, 571100
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2019年08月07日    接受日期: 2019年09月17日    发表日期: 2020年04月30日

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为明确大白菜 TPS (BrTPS)家族成员信息及对高温胁迫信号的响应，本研究利用生物信息学方法，在大白菜基因组数据库中鉴定了 BrTPS 基因家族成员，并对其理化性质、进化特征、蛋白结构及在高温胁迫下的表达模式进行分析。结果表明，大白菜全基因组含有 15 个 TPS 基因家族成员，分布于 8 条染色体上。除BrTPS14 和 BrTPS15 外，其余成员各含有 1 个 TPS 和 1 个 TPP 结构域，并且所含 motif 的排列顺序也完全一致。理化性质分析发现，15 个成员的氨基酸长度介于 129~1 459 aa 之间，分子量大小在 14.73~165.83 kD之间，大部分 BrTPS 蛋白为酸性蛋白和亲水蛋白，以无规则卷曲作为二级结构主要构成元件。进化分析表明，大白菜 TPS 基因家族成员可分为 2 类，其中 ClassⅠ包含 5 个成员，ClassⅡ包含 10 个成员。本研究对高温胁迫前后不同组织和持续高温胁迫下叶片中的表达分析，发现大部分的 BrTPS 基因可对高温胁迫产生响应，但在表达规律上存在差异。这些研究结果为后续研究大白菜 TPS 基因提供一定参考。

大白菜(Brassica campestris L.)；TPS 基因家族；生物信息学；高温胁迫；表达分析