1 濮阳市市容环境卫生管理处, 濮阳, 457000; 2 中国林业科学研究院经济林研究开发中心, 国家林业和草原局泡桐研究开发中心, 经济林种质
创新与利用国家林业和草原局重点实验室, 郑州, 450003
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 10 篇
收稿日期: 2019年07月23日 接受日期: 2019年07月31日 发表日期: 2020年08月18日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 10 篇
收稿日期: 2019年07月23日 接受日期: 2019年07月31日 发表日期: 2020年08月18日
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摘 要
TCP 基因家族是含有 bHLH 基序的植物特有转录因子,广泛参与植物的多种生物过程。为了解桃(Prunus persica)中 TCP 家族的成员和特征,本研究基于其全基因组组装及注释数据,首次在桃基因组中对TCP 基因进行了系统鉴定,并进行了染色体定位、蛋白特征、基因结构、进化关系、启动子区域顺式元件分析。结果显示:桃基因组中共有 20 个 TCP 家族成员,在 7 条染色体上均有分布,其推导蛋白的长度、分子量和等电点差异较大。大部分 TCP 基因不含有内含子,基因结构较为简单。桃 TCP 基因家族含有植物 TCP 家族的所有类别,每一类别均含有保守的且能明显区别于其他类别的特征。TCP 基因家族的启动子区域含大量光应答、激素响应等顺式作用元件,与该基因家族功能的多样性一致。本研究初步探索了桃基因组中 TCP 基因家族的特征,为后期该基因家族在桃中的功能验证提供了理论支撑
关键词
桃(Prunus persica);TCP 基因家族; 系统进化分析;转录因子