刘思成 ¹ , 张作林 ¹ , 赵如飞 ¹ , 熊栋梁 ¹ , 黄见良 ^1,2*

1华中农业大学植物科学技术学院,农业农村部长江中游作物生理生态与耕作重点实验室,武汉, 430070; 2长江大学农学院,主要粮食作物产业化湖北省协同创新中心,荆州, 434000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2019年07月20日    接受日期: 2019年07月26日    发表日期: 2020年07月30日

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摘   要：水通道蛋白(aquaporin, AQP)介导植物各组织间水分转运，参与植物体内物质跨膜转运，在植物各种生理过程中发挥着重要作用。短花药野生稻作为一种具有优良性状的野生稻，其 AQP基因家族成员的特征还尚未了解透彻。为此，本研究鉴定了 39个短花药野生稻的水通道蛋白基因(ObAQP)，根据进化树将其分类，并进行基因结构分析、蛋白质保守基序分析、基因启动子预测和染色体定位分析。结果表明：短花药野生稻中的 AQP可以分为 PIPs、NIPs、TIPs和 SIPs四个亚族；ObAQP蛋白质保守基序大多数都可能参与跨膜转运、通道活动以及膜相关功能；启动子分析表明ObAQP 基因至少含有一个应激反应性顺式元件；ObAQP 基因在染色体上分布并不均匀。以上分析结果简要归纳了短花药野生稻 AQP基因家族的特征，为以后深入研究ObAQP 基因功能未来栽培稻性状改良提供了理论依据。
 

短花药野生稻；AQP；基因家族；生物信息学