1 枣庄学院生命科学学院, 枣庄, 277160; 2 枣庄市石榴研究中心, 枣庄, 277300
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 12 篇
收稿日期: 2019年07月09日 接受日期: 2019年07月17日 发表日期: 2020年08月18日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 12 篇
收稿日期: 2019年07月09日 接受日期: 2019年07月17日 发表日期: 2020年08月18日
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摘 要
本研究以 60 个石榴品种为材料,PCR 扩增获得石榴品种的 matK 基因片段,分析石榴资源的 matK基因序列的碱基组成、序列间碱基变异频率和转换/颠换比率;计算品种间遗传距离(K-2P),构建遗传关系分类图,研究 matK 基因序列对石榴品种鉴定的效果。结果表明,石榴物种的matK 基因片段容易获得,PCR 扩增成功率为 98.3%,测序成功率为 100%,59 个石榴品种 matK 基因片段最长为 897 bp,最短为 820 bp。石榴的 matK 序列保守性为 95.8%,G+C 含量相对稳定,平均含量33.3%,A+T平均含量高达 66.7%,密码子偏好 A 和 T;序列碱基存在转换/颠换比率为1.003,核苷酸多样性为0.000 8,每位点核苷酸多态性指数Theta值为 0.000 54。K-2P 遗传距离在0.000~0.024 之间,平均遗传距离为 0.007,邻接法(NJ)构建 59 个品种遗传关系聚类图,59 个品种被分为 6 大类,分类结果与形态学和品种地理来源分类没有明显相关性。
关键词
matK 基因;石榴品种;遗传关系; DNA 条形码