研究报告

常规粳稻品种遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建  

张锐剑1,2 , 常志远1,2 , 叶胜海2 , 叶靖2 , 翟荣荣2 , 张小明2*
1 浙江师范大学化学与生命科学学院, 金华, 321000; 2 浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所, 杭州, 310021
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 28 篇   
收稿日期: 2019年07月08日    接受日期: 2019年07月18日    发表日期: 2020年09月23日
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摘 要

构建常规粳稻品种指纹图谱、分析遗传多样性和筛选特异性标记可以为水稻品种的亲本选配、品种鉴定和分类评价提供理论依据。本研究以长江中下游稻区和东北稻区的粳稻品种为试验材料,利用分布于12 条染色体上的 SSR 标记进行扩增,通过 8%聚丙烯酰胺凝胶电泳进行标记筛选;分别利用 POPGENE 1.32软件和 NTSYS 2.10e 软件进行遗传多样性和遗传相似性分析并采用 UPGMA 法聚类,PIC-CAL 计算多态信息含量 PIC。结果从 400 SSR 标记中筛选到 190 个多态性标记,对 67 个粳稻品种进行了遗传多样性分析;观测等位基因数的变化范围为 2~6,平均值 2.794 7Shannon's 指数的变化范围为 0.077 8~1.391 6,平均值0.520 9Nei's 基因多样性指数变化范围为 0.029 4~0.707 1,平均值为 0.294 2。多样性分析结果显示,长江中下游稻区粳稻品种与东北粳稻品种间、浙江粳稻品种与江苏粳稻品种间有一定的差异,但总体上观测等位基因、Shannon's 指数和 Nei's 基因多样性指数值较低。遗传相似性分析结果显示,变化范围为 0.531 6~0.957 9,可区分开长江中下游稻区粳稻品种和东北粳稻品种。利用筛选出的 24 个多态性标记用于构建指纹图谱和26 个特异性标记用于品种判别。67 个品种间多样性较丰富,但各地区种植的水稻品种遗传相似性较近。指纹图谱的构建和特异性标记的筛选,为亲本选配、品种权保护、稻米品质的监督与管理提供帮助。
 

关键词
水稻品种;遗传多样性;指纹图谱;特异性标记;品种判别
《分子植物育种》印刷版
• 第 18 卷
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