彭劲谕^1* , 朱泽莉^1* , 李恩良² , 王大玮¹ , 唐红燕³ , 段安安¹

1西南林业大学林学院,云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室,西南山地森林保育与利用省部共建教育部重点实验室,昆明, 650224; 2云南省墨江西岐桫椤省级自然保护区管护局,普洱, 654800; 3普洱市林科所,普洱, 665100
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《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 31 篇   
收稿日期: 2019年07月07日    接受日期: 2019年07月15日    发表日期: 2020年08月25日

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利用 Illumina NovaSeq 6000对云南栘(木衣)进行高通量转录组测序，使用 MIcro SAtellite identification tool (MISA)分析转录组中 SSR位点分布类型与特征。组装获得云南栘(木衣) 111 655条 Unigene，并搜索检测到 32 360个 SSR位点，出现频率为 28.98%，分布平均距离为 3.76 kb。其中以二核苷酸所占比例最高(46.75%)，其次是单核苷酸(34.70%)和三核苷酸(17.10%)。在单核苷酸的重复类型中，A/T重复基元占有较大比例(33.01%)；二核苷酸各重复类型所占比例差距较大，分别为：AG/CT (39.76%)跃AT/TA (3.71%)跃AC/GT(3.20%)跃CG/CG (0.09%)；三核苷酸各重复类型及其所占比例依次为 AAG/CTT (4.52%)、AGG/CCT (3.51%)、ACC/GGT (2.33%)、AGC/CTG (2.28%)和 ATC/ATG (1.20%)，而 AAC/GTT、AAT/ATT、ACG/CGT、ACT/AGT、CCG/CGG基元所占比例较低。在云南栘(木衣)转录组中，由于云南栘(木衣) SSR具有高出现频率，高重复类型和高多态性，为其 SSR开发和遗传多样性分析等研究提供科学的数据参考。 

云南栘(木衣)；转录组；高通量测序；微卫星；特征分析