广西医科大学基础医学院, 生物分子医学研究重点实验室, 南宁, 530021
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 26 篇
收稿日期: 2019年07月05日 接受日期: 2019年08月21日 发表日期: 2020年04月29日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 26 篇
收稿日期: 2019年07月05日 接受日期: 2019年08月21日 发表日期: 2020年04月29日
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摘 要
从绞股蓝转录组挖掘可能与绞股蓝皂苷生物合成相关修饰酶基因细胞色素 P450 (cytochrome P450, CYP)及 UDP- 糖基转移酶(UDP-dependent glycosyltransferase, UGT)基因的 cDNA 进行克隆并开展了以下研究。根据课题组前期绞股蓝转录组数据,筛选 CYP 及 UGT Unigenes,利用 RT-PCR 克隆 ORF 全长,并结合生物信息学对其编码蛋白进行功能分析,最后通过荧光定量 PCR 验证其在根、茎、叶的差异性表达。结果克隆得到两个 ORF 序列,分别命名为 CYP94A1 和 UGT91A1;CYP94A1 序列包含 1 509 bp 的开放阅读框架,编码一条含 503 个氨基酸残基的肽链,具有 CYP 保守结构域;UGT91A1 序列包含 1 383 bp 的开放阅读框架,编码一条含 461 个氨基酸残基的肽链,具有 UGT 保守结构域。这两个基因的转录表达均具有组织特异性,在叶或茎中的表达均高于根。CYP94A1 和 UGT91A1 的克隆、转录表达及生物信息学分析为进一步挖掘绞股蓝中 CYPs、UGTs 及功能验证提供了帮助,增加对 CYP 和 UGT 两个超基因家族的认识。
关键词
绞股蓝(Gynostemma pentaphyllum);CYP94A1;UGT91A1;基因克隆;差异性表达