白建江^1* , 万常照^1* , 朴钟泽¹ , 李钢夑 ² , 杨瑞芳 ^1**

1 上海市农业科院作物育种栽培研究所, 上海, 201403; 2 韩国农村振兴厅农业技术学院, 水原, 441-857, 韩国
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 1 篇   
收稿日期: 2019年06月24日    接受日期: 2019年07月01日    发表日期: 2020年08月17日

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侧根是水稻根系的重要组成部分，具有重要的意义。本研究通过 Illumina Hiseq2000 测序平台，对无侧根突变体 RM109 与其野生型对照根系进行转录组测序，进而比较分析差异表达基因，初步揭示影响水稻侧根发育的相关基因。结果表明无侧根突变体与野生型对照根系相比出现了 2 327 个差异基因，其中上调表达的有 1 131 个，下调表达的有 1 196 个，有 36 个基因表达差异倍数高达 100 倍以上(|log₂Ratio|≥6.7)。通过Gene ontology (GO)数据库、KEGG pathway 数据库比对分析注释差异表达基因的功能和参与的分子调控途径。GO 分析结果表明被注释的差异基因划分成 50 个功能类别，KEGG 分析共有 352 个显著差异基因可以详细注释到 149 条分类代谢途径中，共有 36 个表达差异基因富集于植物激素信号转导途径，36 个差异表达基因中有 2 个是与植物根系生长发育相关的 A ux/IA A 基因，6 个植物生长素响应 SAUR 基因。本研究为进一步为水稻侧根发育分子机理研究提供基础，为水稻根系育种提供理论参考。

水稻(Oryza sativa)；突变体；无侧根；转录组测序