广西壮族自治区亚热带作物研究所, 南宁, 530001
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 5 篇
收稿日期: 2019年06月20日 接受日期: 2019年06月27日 发表日期: 2020年05月22日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 5 篇
收稿日期: 2019年06月20日 接受日期: 2019年06月27日 发表日期: 2020年05月22日
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摘 要
本研究以木薯花芽与叶芽为材料,通过 Illumina HiSeqTM 4000 测序平台对其进行转录组测序,结果获得高质量序列 45 010 506 个、碱基数 13.46 Gb,GC 含量在 43.5%以上、比对效率在 78%以上。筛选得到3 782 个差异表达基因(DEGs),其中上调 2 409 个、下调 1 373 个。DEGs 涉及的主要功能有一般功能预测,翻译,复制、重组与修复,信号传导机制,次生产物合成、运输与代谢,翻译后修饰、蛋白质周转和分子伴侣,氨基酸运输与代谢,碳水化合物运输与代谢。DEGs 显著富集的 KEGG 通路主要有植物激素信号传导、苯丙烷类生物合成、淀粉和蔗糖代谢、苯丙氨酸代谢、氨基酸的生物合成和碳代谢。获得植物开花相关基因 47 个,其中 39 个上调表达、8 个下调表达。研究结果在一定程度上解析了木薯花芽分化的分子机制,并为后续的深入研究提供了基础数据。
关键词
木薯(Manihot esculenta);转录组测序;花芽分化;开花基因