研究报告

草石蚕块茎膨大相关 SSH 文库构建及分析  

耿广东 , 杨祎 , 张素勤*
贵州大学农学院, 贵阳, 550025
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 14 篇   
收稿日期: 2019年06月18日    接受日期: 2019年06月28日    发表日期: 2020年09月15日
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摘 要

为挖掘草石蚕块茎膨大的关键基因,研究其分子机理,以快速膨大的草石蚕块茎为测验方,幼嫩块茎为驱动方,构建了草石蚕块茎膨大相关正向 SSH 文库。从文库中随机挑选阳性单克隆,利用引物 Nest-1Nest-2R 对其进行验证,获得 400 个克隆,插入片段的大小为 200~1 500 bp,主要集中在 500 bp 左右片段。随机挑取 65 个阳性克隆测序后得到 60 ESTs,经过聚类、拼接和冗余去除后获得单拷贝序列 33条,其中序列最长的片段为 1 037 bp,最短片段为 182 bp。通过序列比对,发现 33 条单拷贝序列中来源于蚕豆萎蔫病毒基因占 39.4%,植物基因占 36.4%,其它未知基因占 24.2%。根据同源基因的来源分析,来源于茄科植物的基因所占比例最大(41.67%)。序列编号 20 (632 bp)EST clone cSTB39G13 CENP-C mRNA 基因有63%同源性;序列编号 25 (378 bp)EST 与光敏色素 A 基因有 84%同源性,这两个 ESTs 可能与草石蚕块茎膨大相关。
 

关键词
草石蚕(Stachys sieboldii Miq.);块茎膨大;SSH 文库;表达序列标签
《分子植物育种》印刷版
• 第 18 卷
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