1 广东药科大学, 国家中医药管理局岭南药材生产与开发重点研究室, 广州, 510006; 2 广东药科大学, 中药材国家现代农业产业技术体系, 广州综合试验站, 广州, 510006; 3 云浮市南领药业有限公司, 云浮, 527300
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 29 篇
收稿日期: 2019年06月17日 接受日期: 2019年06月24日 发表日期: 2020年09月14日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 29 篇
收稿日期: 2019年06月17日 接受日期: 2019年06月24日 发表日期: 2020年09月14日
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摘 要
为分析不同来源广金钱草的遗传关系,本研究利用 SLAF-seq 技术对来自广东、广西、海南的 20 份广金钱草样品进行测序,共获得 SLAF 标签 322 360 个,鉴定到 72 395 个多态性 SLAF 标签。进行过滤后开发得到 SNP 多态标记 220 704 个,分析得到 94 505 个高一致性的群体 SNP。通过对 20 份不同来源的广金钱草个体完成系统进化树、群体结构分析,结果表明,20 份广金钱草来源于同一祖先,但由于地理隔离的影响使得个体间发生了遗传分化。通过系统进化树分析发现分布在广东、广西及海南琼中、屯昌的广金钱草具有较近的亲缘关系。研究结果为种质保护和遗传改良提供参考。
关键词
广金钱草(Desmodium styracifolium);SLAF-seq;SNPs 标记; 遗传多样性