研究报告

基于SLAF-Seq技术的广金钱草SNPs标记开发及遗传分析  

唐晓敏1,2 , 张春荣1,2 , 周良云 1,2 , 李龙明3 , 罗碧1,2 , 杨全1,2*
1 广东药科大学, 国家中医药管理局岭南药材生产与开发重点研究室, 广州, 510006; 2 广东药科大学, 中药材国家现代农业产业技术体系, 广州综合试验站, 广州, 510006; 3 云浮市南领药业有限公司, 云浮, 527300
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 29 篇   
收稿日期: 2019年06月17日    接受日期: 2019年06月24日    发表日期: 2020年09月14日
© 2020 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘 要

为分析不同来源广金钱草的遗传关系,本研究利用 SLAF-seq 技术对来自广东、广西、海南的 20 份广金钱草样品进行测序,共获得 SLAF 标签 322 360 个,鉴定到 72 395 个多态性 SLAF 标签。进行过滤后开发得到 SNP 多态标记 220 704 个,分析得到 94 505 个高一致性的群体 SNP。通过对 20 份不同来源的广金钱草个体完成系统进化树、群体结构分析,结果表明,20 份广金钱草来源于同一祖先,但由于地理隔离的影响使得个体间发生了遗传分化。通过系统进化树分析发现分布在广东、广西及海南琼中、屯昌的广金钱草具有较近的亲缘关系。研究结果为种质保护和遗传改良提供参考。 
 

关键词
广金钱草(Desmodium styracifolium);SLAF-seq;SNPs 标记; 遗传多样性
《分子植物育种》印刷版
• 第 18 卷
阅览选项
. 全文 PDF
. 全文 HTML
读者评论
. 评论
作者的其他论文
.
唐晓敏1,2
.
张春荣1,2
.
周良云 1,2
.
李龙明3
.
罗碧1,2
.
杨全1,2*
相关论文
.
广金钱草(Desmodium styracifolium)
.
SLAF-seq
.
SNPs 标记
.
遗传多样性
服务
. 发表评论