项玉婷 , 王景 , 曾俊岚 , 杨春贤 ^*

西南大学生命科学学院,西南大学—西藏农牧学院药用植物联合研发中心,重庆, 400715
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 10 篇   
收稿日期: 2019年06月09日    接受日期: 2019年06月14日    发表日期: 2020年07月30日

这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。

WRKY转录因子家族参与了多种激素调节信号通路，在帮助植物响应外界不良环境中起着重要作用。本研究基于向日葵(Helianthus annuus)基因组数据库对向日葵进行了 WRKY基因家族成员鉴定、进化关系分析、基因定位、基因结构和保守 Motif分析、功能启动子元件和基因共线性分析。结果表明：向日葵中包含 117个 WRKY家族基因，分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ类，其中域类包含Ⅱa、Ⅱb、Ⅱc、Ⅱd和Ⅱe五个亚家族。染色体定位显示HaWRKY 基因在向日葵所有染色体上均有分布，第 10号染色体上分布最多含有 18个HaWRKY 基因，2号和 13号染色体分布最少仅有 3个HaWRKY 基因。向日葵 WRKY转录因子蛋白在 59~940个氨基酸之间，平均氨基酸个数为 345个，等电点为 5.01~10.19不等。基因结构分析表明除HaWRKY52、HaWRKY82不含内含子，其他成员都含有 1~9个不等的内含子。保守域分析表明有 12个 HaWRKY家族基因 WRKYGQK发生了变异，占向日葵 WRKY家族的 10%。此外，启动子分析表明 HaWRKY家族基因启动子区含有大量响应生物胁迫和非生物胁迫元件，共线性分析得到 11对加倍复制基因。本研究结果有助于了解向日葵WRKY基因家族成员的情况，为向日葵 WRKY基因家族成员进一步的功能分析提供基础。
 

向日葵(Helianthus annuus)；WRKY转录因子；进化分析；生物信息学