原晓龙 , 李云琴 , 张劲峰 , 王毅^*

云南省林业科学院, 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室, 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室, 昆明, 650201
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 15 篇   
收稿日期: 2019年05月30日    接受日期: 2019年06月07日    发表日期: 2020年09月15日

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为了解乳油木叶绿体基因组密码子的使用模式，该研究以从乳油木叶绿体基因组中筛选得到 53条长度大于 300 bp 且非重复的 CDS (Coding DNA sequence)序列为材料，利用 Codon W 1.4.2 和在线软件CUSP分析其密码子偏好性。结果显示，密码子第 3 位 GC 含量为 27.47%，ENC 范围在 36.31~56.88，平均值为42.98。RSCU 值大于 1 的密码子有 28 个，其中 27 个以 A 或 U 为结尾。中性绘图分析、ENC-plot 分析和PR2-plot 分析的结果显示乳油木叶绿体基因密码子偏好性主要受突变的影响。最优密码子为 GGA、GAU、CAU 和 UUG。本研究结果为提高异源基因表达水平、改良乳油木重要经济性状等提供参考依据。
 

乳油木(Vitellaria paradoxa)；叶绿体基因组；密码子偏好性；突变