研究报告

香蕉胚胎发育晚期丰富蛋白(MaLEA)家族生物信息学分析  

赵东方 , 苗红霞 , 刘菊华 , 贾彩红 , 王静毅 , 张建斌 , 王卓 , 金志强 , 徐碧玉
1 海南大学热带作物学院,海口, 570228; 2 中国热带农业科学院热带生物技术研究所, 农业部热带重作物生物学与遗传资源利用重科点实验室,海口, 571101
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2019年05月21日    接受日期: 2019年06月24日    发表日期: 2020年06月22日
© 2020 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘 要
晚期胚胎发育丰富蛋白(late embryogenesis abundant protein, LEA)普遍存在于植物中,该家族蛋白 在非生物胁迫下大量积累以保护植物正常生长发育。为了探索 MaLEA家族蛋白在调控香蕉非生物胁迫中 的功能,本研究利用生物信息学方法对 23个香蕉 LEA家族的基因结构、理化性质、亚细胞定位、系统进化、 表达特性及启动子进行初步研究。结果显示: MaLEA家族属于高度亲水蛋白,等电点在 4.6~9.96之间,大多 数定位于细胞质,同时在细胞核、叶绿体和线粒体也有分布。聚类分析发现 MaLEA家族共分为 7组,不同组 间Motif存在一定差异;在启动子序列中,内含子数目为 0~3。转录组数据显示,大多数 MaLEA家族成员在 香蕉果实发育的前期表达量较高;同时, MaLEA3、 MaLEA5、 MaLEA14 和 MaLEA23响应了干旱、盐和冷胁迫。 进一步分析 MaLEA家族基因启动子区响应元件,发现大量响应盐、干旱、高温、低温胁迫、机械损伤和茉莉 酸甲酯、脱落酸激素等的顺式作用元件,推测 MaLEA家族在非生物胁迫中发挥着重要作用,为深入研究香 蕉MaLEA家族基因的功能提供了基础数据。
关键词
香蕉(Musa nana Lour.);胚胎发育晚期丰富蛋白;生物信息学分析
《分子植物育种》印刷版
• 第 18 卷
阅览选项
. 全文 PDF
. 全文 HTML
读者评论
. 评论
作者的其他论文
.
赵东方
.
苗红霞
.
刘菊华
.
贾彩红
.
王静毅
.
张建斌
.
王卓
.
金志强
.
徐碧玉
相关论文
.
香蕉(Musa nana Lour.)
.
胚胎发育晚期丰富蛋白
.
生物信息学分析
服务
. 发表评论