盐生植物海马齿SpCBL10基因的克隆及结构预测  

周扬1,2 , 胡艳平1,3 , 杨成龙1,3 , 段瑞军1 , 符少萍1 , 胡新文3 , 郭建春1
1 中国热带农业科学院生物技术研究所, 农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室, 海口, 571101;
2 华中农业大学植物科学技术学院, 武汉, 430070;
3 海南大学, 海口, 570228
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2014 年, 第 12卷, 第 19 篇   doi: 10.13271/j.mpb.012.000765
收稿日期: 2013年11月26日    接受日期: 2014年01月22日    发表日期: 2014年03月05日
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推荐引用:

Zhou Y., Hu Y.P., Yang C.L., Duan R.J., Fu S.P., Hu X.W., and Guo J.C., 2014, Isolation and structure predicting of the halophyte Sesuvium portulacastrumand L. SpCBL10 gene, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 12(4): 765-771 (周扬, 胡艳平, 杨成龙, 段瑞军, 符少萍, 胡新文, 郭建春, 2014, 盐生植物海马齿SpCBL10基因的克隆及结构预测, 分子植物育种, 12(4): 765-771)

摘 要

本研究以盐生植物海马齿总RNA为模板,采用RT-PCR和RACE技术,获得海马齿SpCBL10基因。生物信息学分析表明:海马齿SpCBL10基因全长1 575 bp,其中CDS序列长度为759 bp,编码252个氨基酸,含有4个典型的结合钙离子的结构域,即EF手臂;SpCBL10蛋白的理论分子量为28.92 kD,等电点为4.74,是一种亲水性的稳定蛋白;该基因编码的蛋白含有一个跨膜区;其蛋白质二级结构中,α-螺旋占52.38%,β-折叠占7.54%,无规则卷曲占32.54%;同源性比对发现它与拟南芥CBL家族中的AtCBL10的相似性最高,达到66.15%,推测其在功能上与AtCBL10类似。本研究结果可为进一步研究SpCBL10基因的功能以及研究海马齿耐盐SOS途径提供理论参考。

关键词
海马齿;SpCBL10;基因克隆;结构预测
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《分子植物育种》印刷版
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