研究报告

甜瓜属 FRK 基因家族的鉴定与特征分析  

徐雅菲1,2 , 孙宇蛟1,3 , 崔浩楠1,2 , 王学征 1,2*
1 东北农业大学, 农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室, 哈尔滨, 150030; 2 东北农业大学园艺园林学院, 哈尔滨, 150030; 3 东北农业大学生命科学学院, 哈尔滨, 150030
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 14 篇   
收稿日期: 2019年05月13日    接受日期: 2019年06月20日    发表日期: 2019年08月27日
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摘 要

果糖激酶是果糖磷酸化过程中主要的催化酶,在植物的生长发育过程中起着非常关键的调节作用。为了深入研究果糖激酶在甜瓜属作物中的结构及理化性质、鉴定出更多潜在的果糖激酶基因,本研究从两个拟南芥(Arabidopsis thaliana)果糖激酶基因(AT-FRK)入手,在葫芦科数据库(http://cucurbitgenomics.org/)中鉴定出甜瓜(Cucumis melo L.)果糖激酶基因 3 条、黄瓜(Cucumis sativus L.)果糖激酶基因 2 条,并利用生物信息学的分析方法对甜瓜属 FRK 基因的结构特征、编码蛋白质的理化性质和结构进行分析,还进行了系统进化树的构建。结果显示,甜瓜属 FRK 基因在染色体上的分布无规律,编码区序列有 996 bp 1 047 bp 2 种大小,亚细胞定位预测有胞外基质和细胞质 2 种情况。FRK 蛋白绝大数为亲水性蛋白,稳定性较好,等电点在酸性范围内,螺旋和无规则卷曲为蛋白二级结构的主要构成形式,高级结构则大部分相似。本研究为甜瓜属作物 FRK 基因结构及功能的进一步发掘提供参考。

关键词
甜瓜属;果糖激酶基因;生物信息学分析
《分子植物育种》印刷版
• 第 17 卷
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