龚婉^* , 吕路琼^* , 王维东 , 黄丽丽^**

西北农林科技大学植物保护学院, 旱区作物逆境生物学国家重点实验室, 杨凌, 712100
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2019年04月30日    接受日期: 2019年05月08日    发表日期: 2020年07月31日

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 本研究以富士苹果(Malus domestica cv. Fuji)为材料，提取总 RNA并反转获得的 cDNA为模板，利用 PCR技术获得苹果短链脱氢酶/还原酶家族基因MdSDR 序列，并结合生物信息学方法对 MdSDR蛋白序列进行分析。结果显示，苹果MdSDR 序列全长 804 bp，编码 267个氨基酸，分子质量约 27.83 kD，等电点为7.69，是一种稳定的疏水蛋白。比对分析发现其编码蛋白氨基酸序列与已选序列中的碧桃、樱花相似性最高，分别达 77.78%和 77.69%，进化分析结果也表明 MdSDR蛋白与碧桃和樱花亲缘关系较近。亚细胞定位结果显示该蛋白主要位于细胞质中。多序列比对分析显示该蛋白含有 SDR家族特有的两个保守结构域：GxxxGxG与 YxxxK。二级结构中β 片层、α 螺旋、无规则卷曲结构分别占比 12.73%、39.70%、47.57%，并含
有典型的βαβ 单元。三级结构预测结果表明该蛋白具有典型的 Rossman折叠结构域。本研究结果为了解苹果中 SDRs蛋白的功能、探讨其在苹果抗逆中的作用、培育苹果抗逆种质资源提供了思路。
 

富士苹果(Malus domestica cv. Fuji)；短链脱氢酶/还原酶； 基因克隆； 序列分析