李玲^* , 闫旭宇^* , 张昊 , 栗现芳 , 王延峰^**

延安大学生命科学学院, 陕西省红枣重点实验室, 延安, 716000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 11 篇   
收稿日期: 2019年04月25日    接受日期: 2019年05月22日    发表日期: 2020年06月24日

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为了研究枣树枣疯病发生的分子机理，基于边合成边测序技术，本研究使用 Illumina 高通量测序平台对健康及感病的木枣树叶片进行转录组测序分析。经过测序质量控制，共得到 Clean Data 55.17 Gb ，各样品 Clean Data 平均为 6.13 Gb，GC%含量为 45.43%，Q30>93.63%，与参考基因组的比对效率在 78.41%~85.77%之间，共发掘 1 909 个新基因。样品间共筛选出 9 593 个差异表达基因，其中上调基因有 6 199 个，下调基因有 3 394 个。同时，还预测出 1 298 个转录因子，归于 55 类转录因子，其中 AP2-EREBP 家族、MYB 家族、bHLH 家族和 C2H2 家族最多，分别有 112 个、90 个、90 个和 85 个。健康木枣与感病木枣(ML vs.WL)注释到各数据库的差异表达基因数(4 755)明显多于其它两个样品组。各样品组间差异表达基因显著富集在黄酮类化合物、苯丙烷类化合物和不饱和脂肪酸生物合成途径，以及植物激素信号转导、淀粉和蔗糖代谢和脂肪酸代谢等代谢通路。该转录组测序分析为寻找枣疯病相关基因提供理论参考。

枣疯病；转录组；高通量测序；差异表达基因