赵庭梅^1,2 , 郑世刚¹ , 胡亚东¹ , 赵若茜¹ , 李红杰^1,2 , 张雪琴^1,2 , 王钦³ , 淳泽^1*

1 中国科学院成都生物研究所, 成都, 610041; 2 中国科学院大学生命科学学院, 北京, 100049; 3 广元市恒昌生物科技有限责任公司, 广元,628003
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《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 30 篇   
收稿日期: 2019年04月18日    接受日期: 2019年05月13日    发表日期: 2020年06月24日

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为了探讨基因组简单重复序列(SSR)在石斛种内遗传分析中的应用价值，本研究从铁皮石斛全基因组 SSR 位点中随机选择了 50 个设计特异性引物。利用聚合酶链式反应(PCR)和聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳分析方法，分别在铁皮石斛、迭鞘石斛和金钗石斛中鉴定出 17 个、15 个和 14 个 SSR 标记，其中 7 对 SSR标记这三种石斛种内均具有良好多态性。结果显示，在各 32 份石斛种内材料间，这些 SSR 标记的平均多态性条带(average polymorphic bands, APD)数大多大于 10，多态信息含量(polymorphism information content, PIC)也几乎均大于 0.5。铁皮石斛种内 SSR 标记的平均 APD 值为 13.18，平均 PIC 值为 0.584；迭鞘石斛种内SSR 标记的平均 APD 值为 12.22，平均 PIC 值为 0.540；金钗石斛种内 SSR 标记的平均 APD 值为 15.20，平均 PIC 值为 0.555。进一步聚类分析发现，基于 SSR 标记条带差异的基因型分型结果与石斛种内材料的表型差异存在一定的相关性。这些结果表明基因组 SSR 标记在不同石斛种间具有较好的转移性，在不同石斛种内均具有良好的多态性，且可用于与表型性状等进行相关性分析，将有助于促进石斛的遗传研究和分子辅助育种，值得进一步地开发和利用。

铁皮石斛；迭鞘石斛；金钗石斛；基因组；SSR 标记；种内鉴定