研究报告

基于 SSR 标记的 76 份紫心甘薯品种的遗传多样性分析  

高闰飞1 , 李强1,2* , 苏在兴1 , 后猛1 , 唐维1 , 杨强强2 , 刘旋旋2 , 闫会1 , 王欣1 , 刘亚菊1 , 张允刚1 , 马代夫1
1 江苏徐淮地区徐州农业科学研究所, 中国农业科学院甘薯研究所, 农业农村部甘薯生物学与遗传育种重点实验室, 徐州, 221131; 2 江苏师范大学生命科学学院, 徐州, 221116
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 43 篇   
收稿日期: 2019年04月15日    接受日期: 2019年05月13日    发表日期: 2020年06月29日
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摘 要

为探明中国育成的紫心甘薯品种之间的遗传多样性和遗传差异,本研究利用 124 SSR 引物对搜集到的 76 个紫心甘薯品种进行遗传多样性分析。通过 6%的聚丙烯酰胺凝胶电泳获得 76 个品种的 PCR 扩增条带数据,构建 0~1 数据矩阵,利用 NTSYS 2.10e 软件计算 Nei's 遗传距离,将遗传距离系数矩阵导入MEGA 7.0.26,进行遗传距离分析和 NJ 聚类分析;利用 Structure 2.3.4 软件进行群体结构分析。结果表明:124 对引物共扩增出 750 条条带,其中多态性条带为 90.13%,每对引物检测出 2~18 个等位变异,平均 6.05 个;76 个紫心甘薯品种的遗传距离在 0.044 2~0.601 0 之间,平均为 0.292 1,进一步分析发现,中国各薯区品种间的遗传距离较近,外引品种绫紫与中国各薯区品种间的遗传距离较远,因此可以通过引进国外紫薯品种来扩大中国紫心甘薯的遗传背景;在遗传距离 0.261 3 处可分为 3 个族群,在 0.225 3 处可分为 9 个族群,在0.217 3 处将第族群划分为 4 个亚群,来源地相近或拥有相同亲本的紫心甘薯材料有聚在一起的趋势;通过对群体结构 K 值分析,发现 76 份品种划分为 3 个稳定的群体,最大 Q 值分析发现,最大 Q 值越大群体的遗传背景就越简单,最大 Q <0.6 时,品种的遗传成分来源于不同群体,群体间存在明显的基因交流,76 个紫心甘薯品种遗传成分有 3 个变异来源。

关键词
紫心甘薯;SSR 标记;遗传多样性分析
《分子植物育种》印刷版
• 第 18 卷
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