广州中医药大学, 中药资源科学与工程研究中心, 岭南中药资源教育部重点实验室, 国家中成药工程技术研究中心南药研发实验室, 广州,510006
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 14 篇
收稿日期: 2019年04月08日 接受日期: 2019年05月22日 发表日期: 2020年06月24日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 14 篇
收稿日期: 2019年04月08日 接受日期: 2019年05月22日 发表日期: 2020年06月24日
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摘 要
WRKY 转录因子在转录调控、次生代谢调控和生长发育中起关键作用。为了了解 WRKY 转录因子在广藿香中的调控模式,本研究从广藿香转录组数据中,筛选获得 WRKY 家族中的 PatWRKY40 和PatWRKY53 基因,利用 PCR 技术克隆得到基因的全长编码区。对 PatWRKY40 和 PatWRKY53 基因进行生物信息学分析。结果表明:PatWRKY40 和 PatWRKY53 基因全长分别为 1 074 bp 和 1 150 bp,编码 213 个和340 个氨基残基,蛋白分子量为 33.31 kD 和 37.79 kD,都属于亲水蛋白,预测其均定位于细胞核。此外,PatWRKY40 和 PatWRKY53 分别属于域类和芋类 WRKY 转录因子,并具有不同的蛋白结构,系统发育树分析这 2 个基因在不同分枝上。利用 RT-PCR 对 PatWRKY40 和 PatWRKY53 的表达模式进行分析,发现PatWRKY40 具有组织表达差异(叶跃花跃茎),PatWRKY40 和 PatWRKY53 在 MeJA 诱导 6 h 后表达量被显著上调了 1.6 倍和 3.2 倍。表明 PatWRKY40 和 PatWRKY53 明显受到 JA 诱导,可能介导 JA 信号通路参与广藿香的发育及代谢调控。本研究首次克隆广藿香的 WRKY 类转录因子并解析其表达模式,为后续 PatWRKY40和 PatWRKY53 的功能鉴定及对其调控网络研究提供理论参考。
关键词
广藿香(Pogostemon cablin);PatWRKY40;PatWRKY53;克隆;表达模式