研究报告

星油藤WOX基因家族成员的鉴定及其表达谱分析  

郭亚静 , 付乾堂 , 胡晓笛 , 陈茂盛 , 潘帮珍 , 陶彦彬 , 何惠英 , 徐增富
1 中国科学院西双版纳热带植物园,种子创新研究院,热带植物资源可持续利用重点实验室,勐腊, 666303; 2 中国科学院大学生命科学学院, 北京, 100049
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 14 篇   
收稿日期: 2019年04月04日    接受日期: 2019年05月06日    发表日期: 2020年06月22日
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摘 要
本研究利用星油藤(Plukenetia volubilis L.)转录组及基因组数据库,通过本地 BLAST,筛选到了 9 个星油藤 WOX (PvoWOX)基因家族成员,并对它们编码的蛋白质氨基酸序列、分子量和等电点等进行了 预测。通过构建系统进化树,将该基因家族成员分为 3个进化支,分别为远古支、中间支和 WUS支;进一步 对 PvoWOX家族成员的基因结构和蛋白保守结构域分析发现在同一进化支中均很保守,并且家族成员均含 有保守的同源异型结构域,其中 WUS支的成员都含有 WUS-box结构域。利用转录组数据和 qRT-PCR 对 PvoWOX基因家族成员在星油藤不同器官中的表达谱进行了分析,结果显示 9 个 PvoWOX 基因成员具有不 同的表达模式,其中 WUS支和中间支成员的表达具有组织特异性,而远古支成员则在不同的器官中均有表 达。 因此推测PvoWOX家族成员具有功能多样性,分别参与调控星油藤不同器官的发育过程。本研究结果为 进一步研究 PvoWOX 的生物学功能提供了帮助。
关键词
星油藤(Plukenetia volubilis);WOX基因家族;生物信息学分析;表达分析
《分子植物育种》印刷版
• 第 18 卷
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