研究报告

辣椒属蔗糖合酶基因家族的鉴定及表达  

魏华伟1 , 柴松琳2 , 胡克玲1 , 高优洋1 , 高朋1 , 梁赛1 , 陈友根1
1 安徽农业大学园艺学院, 合肥, 230036; 2 长江大学园艺园林学院, 荆州, 434000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2019年04月04日    接受日期: 2019年04月24日    发表日期: 2019年08月15日
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摘 要

蔗糖合酶(sucrose synthase, SUS)是植物蔗糖代谢关键酶之一,在植物生长发育和抵御逆境胁迫中具有重要的作用。辣椒基因组的公布为挖掘和鉴定 SUS 提供了机遇。本研究基于已经公布的 5 个辣椒基因组数据信息,利用信息生物学方法对辣椒蔗糖合酶基因家族成员进行鉴定,分析其染色体定位、系统进化关系及表达模式。结果表明:5 个辣椒基因组共编码 25 SUS 蛋白,每个辣椒种均编码 5 个成员;编码氨基酸长度在 787~972 aa 之间,等电点范围位于 5.85~8.26 之间,分子量大小为 87.96~110.27 kD;染色体定位发现一年生栽培辣椒 5 SUS 基因(Capanasus1~Capanasus5)分布于 4 条染色体上,其中 Capanasus3 Capanasus5 基因位于三号染色体;系统进化树将 SUS 基因分为 3 个不同的区组(SUS~SUS),这与模式植物拟南芥分类相一致;通过 RNA-seq 分析发现,2 SUS 基因(Capanasus1 Capanasus2)在花、果皮和种子发育中高度表达,而在叶片中表达量很低,剩下 3 个基因(Capanasus3, Capanasus4 Capanasus5)在所有组织(,, 果皮和种子)发育中表达量较低,甚至不表达。进一步研究发现 3 SUS 基因(Capanasus1, Capanasus2 Capanasus3)受到多种激素(ABA, GA, IAA JA)的诱导,而剩下的 Capanasus4 Capanasus5 基因几乎没有变化;此外,在逆境处理条件下,辣椒 SUS 基因(Capanasus1, Capanasus2 Capanasus3)呈现显著的差异表达,而 Capanasus4 Capanasus5 基因的表达量没有显著变化。这些结果为进一步深入研究辣椒 SUS 基因的功能提供了理论依据。

关键词
辣椒(Capsicum annumm L.);蔗糖合酶;SUS 基因家族;生物信息学;表达分析
《分子植物育种》印刷版
• 第 17 卷
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