马生健^* , 王键 , 文春兰 , 刘金祥

岭南师范学院生命科学与技术学院, 湛江, 524048
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 10 篇   
收稿日期: 2019年04月03日    接受日期: 2019年04月12日    发表日期: 2020年08月21日

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赤桉(Eucalyptus camaldulensis)为桃金娘科桉属下的一个种，抗逆性强。为了了解赤桉 Ec005592 基因，本研究运用一系列生物信息学方法对该基因及其蛋白进行分析，结果显示：该基因具有 4 个开放阅读框，分子量为 47 084.15 Da，理论等电点为 5.03，总亲水性平均值为 -0.107，脂肪族氨基酸指数高达 82.24：Ec005592蛋白中含有三个保守结构域，分别是 Malectin_like 结构域、Malectin 结构域和 LRRNT_2 结构域。二级结构预测得出 Ec005592 蛋白主要由 57.71%无规则卷曲(Randon coil)、26.17%的延伸链(Extended strand)、12.15% α- 螺旋(Alpha helix)和 3.97%的 β- 转角(Beta turn)组成。三级结构的预测结果显示含有 α- 螺旋、β- 折叠和β- 转角。该蛋白质定位细胞外，包括细胞壁中，存在信号肽序列，为分泌性蛋白，共含有 9 个磷酸化位点。推测赤桉 Ec005592 蛋白为富含亮氨酸重复序列类型受体丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。本研究结果为今后进一步深入研究赤桉 Ec005592 基因的功能及其改造提供了理论基础。
 

赤桉；Ec005592基因；丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶；生物信息学