牡丹江师范学院生命科学与技术学院, 牡丹江, 157012
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 16 篇
收稿日期: 2018年12月24日 接受日期: 2019年01月30日 发表日期: 2020年04月29日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 16 篇
收稿日期: 2018年12月24日 接受日期: 2019年01月30日 发表日期: 2020年04月29日
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摘 要
查尔酮合酶(chalcone synthase, CHS)是类黄酮合成途径的关键酶和限速酶,在植物花色素苷形成中具有重要作用,并参与植物的育性、机械损伤的防御反应等。本研究利用生物信息学方法在 RNA-seq 数据中获得了狗枣猕猴桃查尔酮合酶基因(AkCHS1)的序列信息,并对 AkCHS1 进行结构及功能预测。结果表明,狗枣猕猴桃 AkCHS1 的 cDNA 全长为 1 577 bp,CDS 为 1 167 bp,编码蛋白由 389 个氨基酸构成,具有CHS_like 的保守序列,是查尔酮合酶(PLN03169)超家族的一员,是一个亲水性、稳定的蛋白。与其他 19 种植物的查尔酮合酶氨基酸序列进行对比,结果表明,狗枣猕猴桃 AkCHS1 与中华猕猴桃及其变种亲缘关系较近,而与桑树、柑橘等植物亲缘关系较远。本研究为狗枣猕猴桃 AkCHS1 基因功能的进一步研究提供了参考。
关键词
狗枣猕猴桃;查尔酮合酶;生物信息学