中国林业科学研究院热带林业研究所, 国家林业和草原局重点实验室, 广州, 510520
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 31 篇
收稿日期: 2019年03月14日 接受日期: 2019年04月15日 发表日期: 2020年04月30日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 31 篇
收稿日期: 2019年03月14日 接受日期: 2019年04月15日 发表日期: 2020年04月30日
© 2020 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘 要
为更好地发掘和利用现有闽楠种质资源,本研究利用 7 个 SSR 位点对江西和福建 16 个闽楠群体的 237 份材料进行基因型分析,采用逐步聚类(随机取样策略, 位点优先取样策略)和模拟退火算法(等位基因数目最大化策略, 遗传距离最大化策略) 4 种取样方法构建闽楠核心种质,并将各遗传多样性指标进行分析。结果表明:7 个 SSR 位点共检测到 50 个等位基因,平均为 7.143,平均有效等位基因为 2.115,Shannon 信息指数为 0.778,观测杂合度为 0.302,期望杂合度为 0.442。基于逐步聚类方法构建的核心种质相较于基于模拟退火算法构建的核心种质各遗传参数指标都相对较高。对其进行 t 检验后,选择以基于逐步聚类位点优先取样策略在 25%的取样比例下选取的种质为核心种质,其等位基因数、平均有效等位基因数、多态性位点百分率、Shannon 多样性指数的保留率分别为初始种质的 98%、104.92%、90.09%、97.94%。筛选出的 59 份核心种质材料能够较好地代表闽楠种质资源的遗传多样性,为闽楠的种质资源保存提供科学依据。
关键词
闽楠(Phoebe bournei);SSR;遗传多样性;核心种质