查英^1,2 , 白琳^1,2 , 谢小丽² , 王凯² , 元超² , 于福来² , 黄梅² , 官玲亮^2* , 陈松笔^2*

1 黑龙江八一农垦大学农学院, 大庆, 163319; 2 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所, 农业部华南作物基因资源与种质创新重点开放实验室, 海南省艾纳香工程技术研究中心, 海口, 570100
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2018年03月13日    接受日期: 2018年06月28日    发表日期: 2019年11月05日

这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。

AP2/EREBP 是植物特有的一类具有庞大家族的转录因子。该转录因子广泛参与调节植物生理功能和水杨酸、茉莉酸、脱落酸和乙烯等信号转导途径。本研究利用艾纳香的全长转录组数据，通过生物信息学的手段对艾纳香 AP2/EREBP 家族进行挖掘并分析，为从分子水平研究艾纳香代谢调控提供参考依据。利用DNAMAN、MEGA5.05 软件以及 Protparam、SOPMA 在线网站，对艾纳香 AP2/EREBP 转录因子家族的类型、结构域、系统进化、蛋白理化性质和氨基酸序列高级结构等进行分析。结果表明从艾纳香转录组中挖掘到 57 个 AP2/EREBP 基因，通过查找开放阅读框筛选出 18 条能翻译成完整蛋白的序列；根据结构域的划分可分为 DREB、ERF 和 AP2 三个亚族；通过与拟南芥 AP2/EREBP 相关基因进行系统进化分析，结果表明艾纳香 DREB 和 ERF 亚族成员分别属于 B2、B4、B5、B6 和 A6 簇；生物信息学表明艾纳香 AP2/EREBP 转录因子家族蛋白富含酸性氨基酸，热稳定性较高且均为亲水性蛋白，全部蛋白都以无规则卷曲为主；每个亚家族的蛋白质三级结构差异不明显，但不同亚族之间有差异，主要表现在 茁- 转角、茁- 折叠及无规则卷曲长度不同。本研究结果为进一步研究艾纳香 AP2/EREBP 基因功能提供参考。

艾纳香(Blumea blasamifera)；AP2/EREBP；转录因子；生物信息学