北京林业大学生物科学与技术学院, 北京, 100083
作者
通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 12 篇
收稿日期: 2019年03月04日 接受日期: 2019年03月11日 发表日期: 2020年05月25日
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《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 12 篇
收稿日期: 2019年03月04日 接受日期: 2019年03月11日 发表日期: 2020年05月25日
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摘 要
CMK 是 MEP 途径中的第四个关键酶,对于萜类合成代谢具有重要的影响。本研究基于实验室前期获得的山胡椒果实的转录组数据,经过注释筛选出 CMK 基因,首次从山胡椒中克隆得到萜类生物合成关键基因 LgCMK 并对其生物信息学预测分析。结果显示:LgCMK 基因的开放阅读框为 1 221 bp,编码 406 个氨基酸,分子量为 44.78 kD,理论上等电点为 6.26,属 GHMP 蛋白超家族。对 LgCMK 蛋白的氨基酸序列理化性质进行分析,发现蛋白亲水性指数为 -0.332,不稳定性指数为 41.77,属于亲水性不稳定蛋白;亚细胞定位预测结果显示该蛋白定位于叶绿体中。同源性和系统进化分析结果表明,与香樟、博落回和罂粟同源蛋白相似度较高分别为 96.8%、75.96%和 73.0%,不同物种的 CMK 具有较近的亲缘关系,与香樟同属一支,亲缘关系最近。通过本研究生物信息学分析将有助于对 LgCMK 深层次功能探究提供借鉴作用,同时为山胡椒的种质改良提供基因资源。
关键词
山胡椒(Lindera glauca);LgCMK;基因克隆;生物信息学分析