云南省农业科学院经济作物研究所, 昆明, 650205
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 11 篇
收稿日期: 2019年02月25日 接受日期: 2019年03月04日 发表日期: 2020年05月20日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 11 篇
收稿日期: 2019年02月25日 接受日期: 2019年03月04日 发表日期: 2020年05月20日
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摘 要
NAC 蛋白是植物特有的转录因子大家族,作用于植物生长发育和逆境胁迫响应,本研究基于蓖麻全基因组数据,利用生物信息学分析方法对蓖麻 NAC 转录因子家族成员、系统发育、编码蛋白的结构和理化性质进行分析。蓖麻 NAC 转录因子家族包括 91 个成员,分为 14 个亚族,其中蓖麻 NAC 转录因子XII亚族和XII亚族为蓖麻特有 NAC 蛋白;基因结构分析显示内含子数量为 2~5 个,XII 亚族中 12 个成员缺少内含子;蛋白结构域分析显示I、II、III、IV四个亚族蛋白质序列 5 个结构域(Motif)保守性较强,motif 2 几乎存在所有蓖麻 NAC 蛋白中;与拟南芥 105 个 NAC 成员构建系统发育进化树,蓖麻 58 个 NAC 蛋白分别聚类到38 个 OGs,NAC 转录因子的 40 个 OGs 中蓖麻缺少 OG3b 和 OG7f;理化性质和结构分析显示蓖麻 NAC 蛋白质绝大多数是亲水氨基酸,二级结构以无规则卷曲为主,三级结构大部分相似。蓖麻具有很强的抗逆境胁迫能力,本研究为蓖麻耐性相关的 NAC 转录因子调控机理研究提供了科学依据。
关键词
蓖麻;抗逆性;NAC 转录因子;生物信息学