石河子大学农学院, 特色果蔬生理与种质资源利用兵团重点实验室, 石河子, 832000
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 3 篇
收稿日期: 2019年02月23日 接受日期: 2020年05月29日 发表日期: 2020年05月18日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 3 篇
收稿日期: 2019年02月23日 接受日期: 2020年05月29日 发表日期: 2020年05月18日
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摘 要
TALE 转录因子家族广泛存在于植物中,在植物生长发育的各个阶段发挥重要作用,但是目前关于辣椒 TALE 转录因子家族的研究鲜见报道。本研究借助于生物信息学手段,通过 HMMER、SMART、MEGA5.05、GSDS、MEME、DNAMAN、SOPMA、SWISS-MODEL 等软件和网站对辣椒 TALE 转录因子类型、结构域、系谱进化、蛋白理化性质及高级结构、信号肽进行分析。分析显示 20 个辣椒 TALE 转录因子家族成员均含有 HOX 主结构域;系统进化树分析显示,20 个 TALE 转录因子家族成员可分为 KNOX 和 BEL 两个亚族,同一亚族含有相同的保守基序以及相似的基因结构和蛋白跨膜结构;辣椒 TALE 转录因子家族的内含子在 3~6 之间;α- 螺旋和无规则卷曲是该家族基因主要的二级结构,三级结构中都含有螺旋 - 转角 - 螺旋结构。本研究分析了辣椒 TALE 转录因子的生物信息学的特征,结果表明该基因家族在辣椒中具有稳定、保
守的特点,这为今后研究该基因参与的生长发育过程及其作用奠定了一定的理论基础。
关键词
辣椒; TALE;转录因子;生物信息学