王晖 , 谢岩 , 孙志超 , 高玉军 , 张东豪 , 宋永学 , 高妍夏^*

承德医学院蚕业研究所, 河北省高校特产蚕桑应用技术研发中心, 承德, 067000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 28 篇   
收稿日期: 2019年02月13日    接受日期: 2019年02月19日    发表日期: 2020年02月17日

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采用转录组测序技术对三个时期的桑葚进行转录组测序，建立桑葚的 EST 数据库。基于生物信息学方法分析桑葚转录组数据库的简单重复序列位点。从 51 895 条 Unigenes 中共检索出 23 641 条 Unigenes含有 44 867 个简单重复序列位点，共计 252 种基序类型。在所有基序类型中，以 A/T 与 AT/AT 型出现次数最多。单核苷酸基序类型与二核苷酸基序类型出现频率最高，共计 75.69%。基序长度以 10~20 bp 为主，重复次数集中 5~18 次。设计 27 149 对引物，随机选择 20 对引物，通过 PCR 验证，在 4 个桑树品种中展现出良好的重现性与通用性。桑葚转录组 SSR 位点类型丰富，具备开发出适宜于果桑选育的分子标记的潜力。

桑葚(Morus alba L.)； 转录组；简单重复序列位点