陈国鑫 ^1* , 陈冰 ^1* , 李昊澍¹ , 赵坤龙¹ , 秦冠男 ^1,2,3**

1 中国农业科学院生物技术研究所, 北京, 100081; 2 中国科学院亚热带农业生态研究所, 亚热带农业生态过程重点实验室, 长沙, 410125; 3 中国科学院大学, 北京, 100049
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《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 20 篇   
收稿日期: 2019年01月29日    接受日期: 2019年02月05日    发表日期: 2020年05月26日

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水稻(Oryza sativa)的株型含株高、分蘖、穗型和叶型等性状，其表现与光合效率直接相关。一般地，籼稻(Oryza sativa ssp. xian)株型松散，而粳稻(Oryza sativa ssp. geng)更为紧凑。松散型的籼稻自身遮蔽少，通风好，植株光合效率高；紧凑株型的粳稻适应密植，通过提高单位面积植株数量提高总体光合效率。控制籼粳稻分蘖角度差异的主效基因是 TA C1 基因。相比 TA C1^xian，发生在 tac 1^geng 的 3' 非翻译区(3'UTR)的 A→G 突变导致 mRNA 稳定性下降，从而影响了粳稻的株型。2 个等位基因分别属于单株高光效基因型和整体高光效基因型，处于杂合状态下还可互补，因此建立可精确选择 TA C1 等位基因的分子标记在育种实践中意义重大。本研究利用扩增受阻突变系统(amplification refractory mutation system, ARMS)的原理，开发出包含 4 条引物的共显性分子标记，鉴定 TA C1 的功能单核苷酸多态性(functional nucleotide polymorphism, FNP)。该分子标记命名为 tac1fnp，同 TA C1 完全连锁，一次 PCR 反应即可精确区分 2 种等位基因及杂合基因，有助于水稻的高光效分子标记辅助选择育种。
 

水稻(Oryza sativa)；四引物；分子标记；光合效率；TAC1