刘小红

1 西华师范大学, 西南野生动植物资源保护教育部重点实验室, 南充, 637002; 2 西华师范大学生命科学学院, 南充, 637002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 22 篇   
收稿日期: 2019年01月28日    接受日期: 2019年03月06日    发表日期: 2020年04月29日

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水杉(Metasequoia glyptostroboides)是中国著名的一级保护植物，素有“活化石”之称。为了更好地保护和利用这一重要种质资源，本研究以水杉为实验材料，在全长转录组测序的基础上，利用四个软件对61 057 个 Unigenes 进行了蛋白编码潜能预测，最终获得 3 385 个长链非编码 RNA (long non-coding RNAs, lncRNAs)分子。进一步对这些 lncRNAs 的长度和数量作统计分析，结果显示，最短为 200 nt，最长为 11 134 nt，平均长度为 1 956 nt；大部分 lncRNAs 的长度介于 200~2 000 nt，占总量的 59.5%；在 2 001~4 000 nt 的长度范围内，也发现较多的 lncRNAs，达到总量的 32.2%；在长度为 4 001~6 000 nt 的范围内，只有 7.6%；长度超过 6 000 nt 的 lncRNAs 很少，总共只有 25 个(占总量的 0.7%)。本研究结果为水杉资源的保护和利用研究提供了一些分子依据，为其它植物在相关领域的研究提供了一些参考。

水杉(Metasequoia glyptostroboides)；转录组；序列分析；长链非编码 RNA