1 延安大学生命科学学院, 延安, 716000; 2 延安大学, 陕西省红枣重点实验室, 延安, 716000
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 7 篇
收稿日期: 2019年01月22日 接受日期: 2019年03月12日 发表日期: 2020年04月30日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 7 篇
收稿日期: 2019年01月22日 接受日期: 2019年03月12日 发表日期: 2020年04月30日
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摘 要
为探索红枣 GSTU 类基因在红枣抗逆中的分子作用机制,本研究以狗头枣枣树叶片的 DNA 为模板,根据枣 GSTU 基因的序列(HM345954.1)设计引物,采用 PCR 方法获得 GSTU 基因序列,并利用生物信息学手段对其所对应蛋白的结构域、功能域、理化特性、跨膜区、二级结构及亚细胞定位等进行分析。结果表明:克隆到的 DNA 序列全长 838 bp,具有 2 个外显子和 1 个内含子,内含子在 292~460 bp 碱基处,该序列与GenBank 中枣的 GSTU 核苷酸序列和氨基酸序列的同源性分别为 99.85%和 100%,表明成功的克隆了狗头枣的 GSTU 基因。该序列编码 222 个氨基酸,分子量为 25.268 kD,理论等电点(pI)为 6.10;亲水性的平均数为-0.242,表明该蛋白是亲水性蛋白。二级结构主要以 琢- 螺旋为主,其次是无规则卷曲,不存在信号肽,表明该蛋白可能为非分泌性蛋白,该蛋白可能位于内质网(膜)和质膜上。本研究获得的狗头枣 GSTU 基因在基因结构上含有 1 个内含子,在核酸序列及氨基酸序列上与 GenBank 中枣的 GSTU 基因同源性高,并对其理化性质、结构等进行了预测与分析,为进一步研究红枣抗逆分子机制提供理论基础,同时为红枣品种的选育提供理论支持。
关键词
狗头枣;GSTU 基因;基因克隆;序列分析