刁卫平 , 王述彬 , 刘金兵 , 潘宝贵 , 戈伟

江苏省农业科学院蔬菜研究所, 南京, 210014
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2013 年, 第 11卷, 第 19 篇   doi: 10.3969/mpb.011.000795
收稿日期: 2013年08月27日    接受日期: 2013年10月22日    发表日期: 2013年10月29日

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分析辣椒属ITS序列，为辣椒属系统位置、进化关系提供分子生物学依据。以辣椒属(Capsicum) 4个栽培种36份不同基因型辣椒种质资源为供试材料，对其rDNA转录间隔区(internal transcribed spacers, ITS)进行PCR扩增。扩增产物经纯化、克隆和测序后，获得ITS序列信息，利用MEGA 5.05软件分析其序列特征，并探讨辣椒属种质资源的系统进化关系。结果表明，辣椒属ITS基本序列全长656 bp，G＋C含量57.47%。供试材料的ITS序列长度变异较大，ITS1、5.8S和ITS2区长度变异都有发生。序列比对表明，供试辣椒材料ITS区共有387个变异位点(ITS1: 153; 5.8S: 82; ITS2: 152)，信息位点322个，同源性为71.0%~100%，遗传分歧为0.0~0.360 4。以烟草为外类群，将ITS1、5.8S和ITS2序列作为一个共同的数据矩阵进行系统发育树构建，辣椒属C. frutescens和C. baccatum种被单独分出，C. chinense和C. annuum种聚在一起，C. annuum与其他3个栽培种的亲缘关系由近至远分别是C. chinense、C. frutescens和C. baccatum，C. annuum种的32份供试材料主要分为3个分支6个亚分支，聚类分析结果与形态分类不能完全对应。

辣椒属；ITS；系统发育；亲缘关系