何芳¹ , 李国泽¹ , 丁勇^1* , 李雪¹ , 贾士霖¹ , 赵展平^1,2 , 赵平²

1 西南林业大学, 云南省高校林木生物技术重点实验室, 昆明, 650224; 2 西南林业大学, 西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室, 昆明, 650224
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 1 篇   
收稿日期: 2019年01月18日    接受日期: 2019年02月12日    发表日期: 2020年04月30日

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广泛存在于生物体内的 CYP450 具有参与多种内源物质的新陈代谢和解除外源化学物质毒害作用的功能。本研究基于 RNA-Seq 数据，应用 RT-PCR 技术首次从樟叶越桔中克隆获得 21 个 CYP450 基因cDNA 片段。应用生物信息学技术对 21 个樟叶越桔 CYP450 基因进行相似性分析、功能注释、家族分类以及聚类分析，除 2 个基因的家族分类不明确外，其余所有基因被分属于 10 个不同的 CYP450 家族中，分别为：CYP71、CYP72、CYP76、CYP81、CYP82、CYP86、CYP94、CYP97、CYP734 和 CYP735。推测有 10 个基因参与脂肪族、芳香族碳的羟基化，4 个基因参与植物激素细胞分裂素的合成与降解，3 个基因参与脂肪酸的羟基化，2 个基因参与萜类化合物的合成。而 KEGG 分析结果显示 2 个基因家族未知的樟叶越桔 CYP450 基因可能参与了 K00327 途径。21 个樟叶越桔 CYP450 基因能成功地与 24 个拟南芥 CYP450 基因聚类到一起。值得关注的是有 2 个樟叶越桔 CYP450 基因 CL75.Contig1_2A(9)和 Unigene22570_2A(14)被归类到拟南芥所特有的 CYP82 家族中，分别属于 CYP82D 和 CYP82G 亚家族，这为研究 CYP82 基因家族新物种来源提供了参考。本研究结果为认识樟叶越桔细胞色素 CYP450 基因和家族分类提供了信息，为樟叶越桔 CYP450 功能研究提供了参考依据。

樟叶越桔(Vaccinium dunalianum Wight)；CYP450；基因克隆；基因家族；序列分析