研究报告

菜豆 TIFY 基因的全基因组鉴定与系统进化分析  

胡利宗 1,2 , 李超琼1 , 张雯露1 , 王雪芹1 , 刘红占1 , 纪秀娥 1*
1 周口师范学院生命科学与农学学院, 周口, 466001; 2 周口师范学院, 河南省作物分子育种与生物反应器重点实验室, 周口, 466001
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2019年01月21日    接受日期: 2019年01月28日    发表日期: 2020年05月28日
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摘 要

TIFY 蛋白是植物特异性转录因子,在植物生长、发育和基因调控中具有重要作用。尽管部分菜豆 TIFY 基因被鉴定与研究,但从基因组水平剖析 TIFY 基因家族的研究未见报道。结合基因组和转录组学数据,本研究系统剖析了菜豆 TIFY 基因家族的序列、选择、表达及进化特征。结果显示:18 PvTIFY 基因散落分布在 9 条染色体上,共线性鉴定出 6 对片段重复基因和 1 对串联重复基因,同时这些基因被分为 6 大类群;序列分析表明,菜豆 TIFY 基因有 12 种基因结构模式,但有 5 种保守基序组成模式,这说明保守基序模式更保守;选择压力检测显示,同源基因对均受到负选择作用,显示较高的保守性;表达分析揭示了菜豆 TIFY 家族基因具有多样化的表达模式,其中同源基因对表达模式发生趋异现象。这些结果为深入研究菜豆 TIFY 蛋白的生理功能提供了参考。
 

关键词
菜豆;TIFY 基因;基因组;系统进化
《分子植物育种》印刷版
• 第 18 卷
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