张咏祀 , 刘小红

西华师范大学生命科学学院, 西南野生动植物资源保护教育部重点实验室, 南充, 637002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 27 篇   
收稿日期: 2018年12月31日    接受日期: 2019年02月05日    发表日期: 2020年02月12日

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水杉是中国著名的一级保护植物，为了充分开发和利用这一重要种质资源，本研究在水杉全长转录组测序的基础上，对水杉 SSR (Simple sequence repeat)序列进行了详细序列分析。共发现 SSR 序列 16 227个，其中以单核苷酸为重复单位的最多，达到 10 290 个，长度介于 10~50 nt 的为绝大部分，达到总数的 96.1%，其余为 51~315 nt，仅占 3.9%。以二、三、四、五和六核苷酸为重复单位的 SSR 序列分别有 1 156、1 789、25、11、54 个，长度范围分别于介于 12~58 nt、15~60 nt、20~44 nt、25~30 nt 和 30~36 nt。此外，还发现有 2 902 个复杂 SSR 序列，长度介于 21~4 760 nt。该结果为水杉 SSR 分子标记开发和水杉基因资源的保护利用提供了分子依据。

水杉(Metasequoia glyptostroboides)；全长转录组；序列分析；SSR